Projets de recherches en cours
1) Doctorant en Génomique Computationnelle
Université Grenoble Alpes - Octobre 2023 à Septembre 2026
Projet de recherche : Développement de techniques d'apprentissage automatique pour la découverte de nouveaux systèmes de sécrétion chez les prokaryotes.
Données utilisées : génomes de procaryotes avec le niveau d'assemblage complet NCBI 2023
2) Projet personnel durant mes temps libre
en collabotion avec Samira Ebrahimi Kahou - Professeure adjointe à l'Université de Calgary
Projet de recherche : Developpement des architecture des modeles d'apprentissage profond personalisé.
Paper published at ICLR 2025 : Lien vers la publication
3) Projet personnel durant mes temps libre
Finetune du modèle Google segment anything (SAM2) avec des images médicales (actuellement des images d'échographie, de radiographie et de mammographie du cancer du sein) dans le but de segmenter la tumeur et de prédire le statut (cancer ou non).
Projets de recherches antérieurs
1) Stage de Master 2 pour le Master en Evolution et Génétique Sorbonne Université
Gmt Science - Février à Août 2023
Projet de recherche : Developpement des méthodes d'apprentissage automatique pour l'identification des signature robuste du microbiome à partir de données métagénomiques. Études de cas : cirrhose du foie, cancer colorectal.
2) Stage de 3 mois
L’Institut Diversité, Écologie et Évolution du Vivant - Octobre 2022 à Janvier 2023
Projet de recherche : Etude de l'impact des changements phénologiques sur la composition bactérienne de la rhizosphère (rhizobiome) du maïs par métabarcoding.
3) Stage de Master 2 pour le Master de Mathematiques, Modelisation et Apprentissage de l'Université Pais Cité
BioSTM Lab - Février à Août 2022
Projet de recherche : Analyse transcriptomique à l'aide de la méthode de normalisation par randomisation intensive.
4) Assistant de recherche à Univerité des science appliquée de Mittweida, Allemagne
Maths Against Malaria Lab - Mars 2021 à Novembre 2022
Missions : Enseignements et Recherches.
5) Stage de Master 2 pour le Master de Mathematiques à AIMS, Cameroon
Superviseur: Prof. Kristan A. Schneider - Février à May 2020
Projet de recherche: An application of the EM-algorthm to estimate the multiplicity of infection based on the Negative Binomial Distribution.
Ongoing research projects
1) PhD Candidate in Computational Genomics
Université Grenoble Alpes - Octobre 2023 to September 2026
Research Project: Development of machine learning models for the discovery of new secretion systems in prokaryotes.
Data used: prokaryote genomes with NCBI full assembly level 2023
2) Personal project in my free time
In collaboration with Samira Ebrahimi Kahou - Assistant Professor at the University of Calgary
Research project: Development of architecture for personalized deep learning models.
Paper published at ICLR 2025 : Link to the paper
3) Personal project in my free time
Finetuning the Google segment anything model (SAM2) with medical images (currently ultrasound, X-ray and mammography images of breast cancer) with the aim of segmenting the tumor and predicting status (cancer or not).
Previous research projects
1) Internship for Master 2 in Evolution and Genetics at Sorbonne University
Gmt Science - Febuary to August 2023
Research Project: Development of machine learning methods to identify robust microbiome signatures from metagenomic data. Case studies: liver cirrhosis, colorectal cancer.
2) 3 months internship
L’Institut Diversité, Écologie et Évolution du Vivant - October 2022 to January 2023
Research Project: Study of the impact of phenological changes on the rhizosphere bacterial composition (rhizobiome) of maize by metabarcoding.
3) Internship for Master 2 in Mathematics, Modeling and Learning at Paris cité University
BioSTM Lab - Febuary to August 2022
Missions : Transcriptomic analysis using the intensive randomization normalization method.
4) Research assistant at the University of Applied sciences Mittweida, Germany
Maths Against Malaria Lab - March 2021 to November 2022
Missions : Teachings and Research.
5) Internship for Master 2 mathematics at AIMS, Cameroon
Supervisor : Kristan A. Schneider - Febuary to May 2020
Research Project: An application of the EM-algorthm to estimate the multiplicity of infection based on the Negative Binomial Distribution.